grabseqs——小白也能轻松上手的SRA数据处理神器 grabseqs是一款能够批量下载SRA数据并直接转换为fastq文件的工具,本文通过个人视角详细介绍了其使用方法及优势,适合生物信息学初学者阅读。 简书热点 2025年02月13日 22:32 0 点赞 0 评论 65 浏览
零基础RNA-seq转录组分析实践:NGS新手的进阶之路 本文以第一人称视角讲述了如何通过两套不同的方案进行零基础RNA-seq转录组分析,包括环境搭建和云平台使用,并结合实际案例展示了其应用价值。 简书热点 2025年02月14日 15:05 0 点赞 0 评论 57 浏览
Aspera——数据下载界的“火箭”,用SRR号批量高效获取FASTQ或SRA数据 Aspera是一款高效的生物信息学数据下载工具,可利用SRR号批量下载FASTQ或SRA数据,显著提升科研效率。本文通过个人视角分享了Aspera的使用方法及其优势。 简书热点 2025年02月14日 19:35 0 点赞 0 评论 61 浏览
SRA文件处理速度大比拼:fastq-dump、fasterq-dump和parallel-fastq-dump谁更胜一筹? 本文详细比较了fastq-dump、fasterq-dump和parallel-fastq-dump在处理SRA文件时的速度表现,通过实验数据帮助读者选择合适的工具。 简书热点 2025年02月15日 23:50 0 点赞 0 评论 59 浏览
铁死亡研究新突破:纯生信也能发Cell子刊! 本文详细介绍了上海交通大学医学院附属仁济医院薛婧团队利用纯生信方法在铁死亡研究领域取得的重要突破,并探讨了该研究对未来科研及癌症治疗的深远影响。 简书热点 2025年02月16日 18:51 0 点赞 0 评论 63 浏览
序列比对软件 MUMmer 简单上手(一):小白也能轻松搞定 本文详细介绍了序列比对软件MUMmer的基本使用方法,包括安装步骤、基础命令以及实战案例,帮助初学者快速掌握该工具的核心功能。 简书热点 2025年02月18日 00:05 0 点赞 0 评论 63 浏览
单细胞数据分析入门:R数据格式(RData、RDA、RDS)的那些事儿 本文以通俗易懂的方式介绍了R语言中RData、RDA和RDS文件的基本概念及其操作方法,并通过实战案例详细讲解了如何在单细胞数据分析中应用这些文件格式。 简书热点 2025年02月19日 02:51 0 点赞 0 评论 50 浏览
四步搞定单细胞数据调控网络分析:SCENIC/pySCENIC全流程解析 本文以个人视角详细介绍了如何使用SCENIC/pySCENIC完成单细胞数据调控网络分析,包含安装、数据预处理、调控网络推断以及结果可视化等核心步骤,内容通俗易懂,适合初学者学习。 简书热点 2025年02月21日 00:12 0 点赞 0 评论 73 浏览
生物信息学实战:用Seurat和SoupX解决RNA污染问题 本文详细介绍了如何结合Seurat和SoupX去除单细胞RNA测序中的环境RNA污染,从问题背景到具体操作步骤,再到最终的结果评估,全面展示了这一方法的应用价值。 简书热点 2025年02月22日 17:32 0 点赞 0 评论 56 浏览
用R包Seurat封装函数,轻松搞定单细胞数据分析 本文详细介绍了如何使用R包Seurat封装函数,简化单细胞数据分析流程。文章以个人视角出发,分享了封装函数的实际应用案例以及带来的效率提升。 简书热点 2025年02月22日 21:56 0 点赞 0 评论 57 浏览