Seurat的subset数据提取方法,我终于搞懂了! 作为一名生物信息学爱好者,在学习单细胞数据分析过程中,深入研究了Seurat中的subset函数,详细介绍了其基础语法、实战应用以及使用技巧,帮助读者更好地理解和掌握这一核心数据提取方法。 简书热点 2025年05月11日 13:53 0 点赞 0 评论 54 浏览
拷贝数变异分析:轻松搞定GISTIC输入文件 小明在研究拷贝数变异的过程中,学会了如何制作GISTIC输入文件。他详细记录了从数据准备到实际操作的每一步,分享了自己的心得与经验。 简书热点 2025年04月27日 12:40 0 点赞 0 评论 50 浏览
GTF处理脚本 - GTFtools:数据科学家的福音 作为一名数据科学家,他在简书平台上发现了GTFtools这一强大工具。通过实际应用,他深刻体会到GTFtools在处理GTF格式文件时的高效与便捷,为基因组学研究带来了新的可能性。 简书热点 2025年04月16日 10:32 0 点赞 0 评论 47 浏览
iTAK:在线预测全基因组转录因子TF,转录调节因子TR与蛋白激酶PK的革命性工具 作为一名热爱科学研究的人,他深入探讨了iTAK这一在线预测工具在全基因组转录因子TF、转录调节因子TR与蛋白激酶PK中的应用价值。通过对北京大学徐成冉课题组最新研究成果的解读,展现了转录因子在细胞分化中的重要作用,同时展望了这一领域未来的发展前景。 简书热点 2025年04月06日 14:46 0 点赞 0 评论 49 浏览
GeneToCN:一种革命性的基因拷贝数估计方法 作为一名热爱基因组学的探索者,我最近接触到了一个令人惊叹的新工具——GeneToCN。它是一种直接从NGS数据中估计基因拷贝数的alignment-free方法,彻底改变了传统分析流程。我将带你深入了解它的原理、优势以及实际应用案例。 简书热点 2025年03月28日 15:27 0 点赞 0 评论 51 浏览
从零开始:将转录组SRR数据组装为FASTA文件的个人实战记录 作为一名热爱生物信息学的学习者,我尝试将SRR格式的转录组数据组装成FASTA文件。本文详细记录了我的学习过程,包括SRR数据下载、数据预处理、转录组组装以及最终导出FASTA文件的完整流程。希望我的经历能帮助更多入门者快速上手。 简书热点 2025年03月23日 04:11 0 点赞 0 评论 54 浏览
小白也能轻松掌握:如何下载基因组注释文件和复制链接(以GCA_000817325.1为例) 本文以第三者的视角详细讲述了如何下载基因组注释文件的过程,特别是以GCA_000817325.1为例,从选择数据库到具体操作步骤,再到可能遇到的问题及解决方案,都进行了深入浅出的讲解。 简书热点 2025年03月22日 04:12 0 点赞 0 评论 76 浏览
单细胞WGCNA分析:揭开恶性肿瘤预测的新篇章 本文以一位年轻科研工作者的视角,详细介绍了hdWGCNA这一单细胞WGCNA分析方法的核心原理及其在恶性肿瘤研究中的应用,尤其是如何通过PRS识别低存活率的STAD患者。文章结合真实案例,深入探讨了该技术的挑战与未来前景。 简书热点 2025年03月20日 12:37 0 点赞 0 评论 52 浏览
Nature子刊新突破:scMerge2带你走进单细胞研究的未来 本文以个人视角解读Nature子刊上的scMerge2技术,探讨其在单细胞研究中的应用价值,并结合学术家谱和GLUE模型分析师生代际关系及调控推断的重要性。 简书热点 2025年03月17日 16:07 0 点赞 0 评论 55 浏览
从数据中挖掘癌症代谢秘密:NC | METAFlux工具的崛起 本文介绍了METAFlux这一新兴生物信息学工具如何从bulk和单细胞RNA-seq数据中表征癌症代谢通量,并探讨了其在癌症研究中的重要意义及未来应用前景。 简书热点 2025年03月17日 15:45 0 点赞 0 评论 53 浏览