零基础RNA-seq转录组分析实践:NGS新手的进阶之路 本文以第一人称视角讲述了如何通过两套不同的方案进行零基础RNA-seq转录组分析,包括环境搭建和云平台使用,并结合实际案例展示了其应用价值。 简书热点 2025年02月14日 15:05 0 点赞 0 评论 81 浏览
Xena助力科研:TCGA数据下载的高效神器 介绍Xena作为TCGA数据下载的高效工具,分享个人使用体验以及其在生物信息学研究中的重要性。 简书热点 2025年02月12日 02:06 0 点赞 0 评论 82 浏览
Seurat数据结构初探:从小白到入门的进阶之旅 本文以个人视角详细记录了从零基础学习Seurat数据结构的过程,涵盖核心概念解析、实际应用案例以及学习心得,帮助读者快速入门单细胞数据分析。 简书热点 2025年03月11日 02:32 0 点赞 0 评论 82 浏览
铁死亡研究新突破:纯生信也能发Cell子刊! 本文详细介绍了上海交通大学医学院附属仁济医院薛婧团队利用纯生信方法在铁死亡研究领域取得的重要突破,并探讨了该研究对未来科研及癌症治疗的深远影响。 简书热点 2025年02月16日 18:51 0 点赞 0 评论 83 浏览
非模式物种KEGG富集数据库准备(二):小白的进阶之旅 本文以第一人称视角讲述了小白在非模式物种KEGG富集数据库准备中的学习经历,包括数据收集、工具使用及结果解读等内容,旨在帮助更多初学者了解并掌握相关技能。 简书热点 2025年02月24日 12:36 0 点赞 0 评论 83 浏览
生物信息学实战:用Seurat和SoupX解决RNA污染问题 本文详细介绍了如何结合Seurat和SoupX去除单细胞RNA测序中的环境RNA污染,从问题背景到具体操作步骤,再到最终的结果评估,全面展示了这一方法的应用价值。 简书热点 2025年02月22日 17:32 0 点赞 0 评论 83 浏览
从零开始的基因组比对之旅:Nanopore三代测序Fastq的革新力量 本文从个人视角出发,深入探讨了Nanopore三代测序Fastq在基因组比对中的应用,揭示了其相较于传统多平台组合的优势以及未来的发展潜力。 简书热点 2025年03月11日 09:40 0 点赞 0 评论 84 浏览
SRA文件处理速度大比拼:fastq-dump、fasterq-dump和parallel-fastq-dump谁更胜一筹? 本文详细比较了fastq-dump、fasterq-dump和parallel-fastq-dump在处理SRA文件时的速度表现,通过实验数据帮助读者选择合适的工具。 简书热点 2025年02月15日 23:50 0 点赞 0 评论 84 浏览
跟着Nature Communications学数据分析:R语言利用宏基因组的相对丰度数据做主坐标分析(PcoA) 本文介绍了如何使用R语言进行宏基因组相对丰度数据的主坐标分析(PcoA),并通过实际案例展示了其在生物学研究中的应用。 简书热点 2024年12月01日 12:56 0 点赞 0 评论 85 浏览
跟着Nature Medicine学作图:复杂热图的进阶之路 本文通过个人视角分享了如何利用Nature Medicine中的经典案例学习绘制复杂热图的过程,详细介绍了数据准备、绘图工具选择、基础热图绘制、辅助信息添加及排版优化等关键步骤。 简书热点 2025年02月11日 08:11 0 点赞 0 评论 85 浏览