跟着Nature Medicine学作图:复杂热图的进阶之路 本文通过个人视角分享了如何利用Nature Medicine中的经典案例学习绘制复杂热图的过程,详细介绍了数据准备、绘图工具选择、基础热图绘制、辅助信息添加及排版优化等关键步骤。 简书热点 2025年02月11日 08:11 0 点赞 0 评论 60 浏览
生物信息学实战:用Seurat和SoupX解决RNA污染问题 本文详细介绍了如何结合Seurat和SoupX去除单细胞RNA测序中的环境RNA污染,从问题背景到具体操作步骤,再到最终的结果评估,全面展示了这一方法的应用价值。 简书热点 2025年02月22日 17:32 0 点赞 0 评论 56 浏览
解锁10X空间转录组数据:功能信号网络的奥秘 本文以个人视角深入探讨10X空间转录组数据分析中的Ligand-Receptor-Downstream Genes Network功能信号网络,结合实际案例解析其原理与应用价值。 简书热点 2025年03月03日 10:57 0 点赞 0 评论 54 浏览
转录组DEGs聚类热图和功能富集分析:从入门到精通 本文从个人视角出发,详细介绍了转录组差异表达基因(DEGs)的聚类热图绘制和功能富集分析的方法与应用,结合实际案例和代码示例,帮助读者更好地理解和掌握这一重要技术。 简书热点 2024年12月03日 20:25 0 点赞 0 评论 63 浏览
Aspera——数据下载界的“火箭”,用SRR号批量高效获取FASTQ或SRA数据 Aspera是一款高效的生物信息学数据下载工具,可利用SRR号批量下载FASTQ或SRA数据,显著提升科研效率。本文通过个人视角分享了Aspera的使用方法及其优势。 简书热点 2025年02月14日 19:35 0 点赞 0 评论 61 浏览
用maftools包分析突变数据,绘制瀑布图:小白也能轻松上手 本文详细介绍了如何使用maftools包分析突变数据,并绘制出精美的瀑布图。从安装到实际操作,每一步都配有详细的代码示例,让即使是初学者也能轻松掌握。 简书热点 2025年03月01日 00:27 0 点赞 0 评论 49 浏览
GTF处理脚本 - GTFtools:数据科学家的福音 作为一名数据科学家,他在简书平台上发现了GTFtools这一强大工具。通过实际应用,他深刻体会到GTFtools在处理GTF格式文件时的高效与便捷,为基因组学研究带来了新的可能性。 简书热点 2025年04月16日 10:32 0 点赞 0 评论 48 浏览
ChIPseeker绘图函数借用:从初学者到进阶者的蜕变 本文从个人视角出发,详细介绍了ChIPseeker绘图函数的使用方法和技巧,分享了从初学者到进阶者的成长历程,并展望了ChIPseeker在未来的发展前景。 简书热点 2024年11月30日 06:32 0 点赞 0 评论 80 浏览
单细胞WGCNA分析:揭开恶性肿瘤预测的新篇章 本文以一位年轻科研工作者的视角,详细介绍了hdWGCNA这一单细胞WGCNA分析方法的核心原理及其在恶性肿瘤研究中的应用,尤其是如何通过PRS识别低存活率的STAD患者。文章结合真实案例,深入探讨了该技术的挑战与未来前景。 简书热点 2025年03月20日 12:37 0 点赞 0 评论 52 浏览
转录组分析(三):GO与KEGG富集分析及可视化实战 本文详细介绍了转录组分析中GO与KEGG富集分析的具体步骤及其实现方法,并结合条形图和气泡图展示了差异基因的功能解读,帮助读者快速掌握相关技能。 简书热点 2025年02月11日 13:07 0 点赞 0 评论 62 浏览