转录组DEGs聚类热图和功能富集分析:从入门到精通 本文从个人视角出发,详细介绍了转录组差异表达基因(DEGs)的聚类热图绘制和功能富集分析的方法与应用,结合实际案例和代码示例,帮助读者更好地理解和掌握这一重要技术。 简书热点 2024年12月03日 20:25 0 点赞 0 评论 93 浏览
科研之路:8篇SCI加持下的机器学习与生物信息学探索 本文讲述了一位科研工作者如何将机器学习、WGCNA、免疫浸润等技术应用于生物信息学研究,并克服投稿困难的经历。 简书热点 2025年03月01日 09:06 0 点赞 0 评论 92 浏览
Aspera——数据下载界的“火箭”,用SRR号批量高效获取FASTQ或SRA数据 Aspera是一款高效的生物信息学数据下载工具,可利用SRR号批量下载FASTQ或SRA数据,显著提升科研效率。本文通过个人视角分享了Aspera的使用方法及其优势。 简书热点 2025年02月14日 19:35 0 点赞 0 评论 92 浏览
【R画图学习22.1】进化树和气泡组合图:探索数据可视化的艺术 本文介绍了如何使用R语言绘制进化树和气泡图的组合图,展示了其在生物信息学领域的应用,并通过实际案例详细解释了操作步骤。 简书热点 2024年12月09日 07:47 0 点赞 0 评论 91 浏览
单细胞数据分析新神器:scCustomize带你玩转数据可视化 本文介绍了scCustomize这款强大的单细胞数据分析工具,详细描述了其功能特点及使用方法,并通过具体案例展示了如何利用该工具实现数据的自定义可视化。 简书热点 2025年02月23日 11:21 0 点赞 0 评论 89 浏览
跟着Nature Medicine学作图:复杂热图的进阶之路 本文通过个人视角分享了如何利用Nature Medicine中的经典案例学习绘制复杂热图的过程,详细介绍了数据准备、绘图工具选择、基础热图绘制、辅助信息添加及排版优化等关键步骤。 简书热点 2025年02月11日 08:11 0 点赞 0 评论 88 浏览
生物信息学实战:用Seurat和SoupX解决RNA污染问题 本文详细介绍了如何结合Seurat和SoupX去除单细胞RNA测序中的环境RNA污染,从问题背景到具体操作步骤,再到最终的结果评估,全面展示了这一方法的应用价值。 简书热点 2025年02月22日 17:32 0 点赞 0 评论 88 浏览
SRA文件处理速度大比拼:fastq-dump、fasterq-dump和parallel-fastq-dump谁更胜一筹? 本文详细比较了fastq-dump、fasterq-dump和parallel-fastq-dump在处理SRA文件时的速度表现,通过实验数据帮助读者选择合适的工具。 简书热点 2025年02月15日 23:50 0 点赞 0 评论 87 浏览
跟着Nature Communications学数据分析:R语言利用宏基因组的相对丰度数据做主坐标分析(PcoA) 本文介绍了如何使用R语言进行宏基因组相对丰度数据的主坐标分析(PcoA),并通过实际案例展示了其在生物学研究中的应用。 简书热点 2024年12月01日 12:56 0 点赞 0 评论 87 浏览
从零开始的基因组比对之旅:Nanopore三代测序Fastq的革新力量 本文从个人视角出发,深入探讨了Nanopore三代测序Fastq在基因组比对中的应用,揭示了其相较于传统多平台组合的优势以及未来的发展潜力。 简书热点 2025年03月11日 09:40 0 点赞 0 评论 87 浏览